Kérdés:
A genetikai kód redundanciája
user9950
2014-10-27 16:24:16 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Egy adott kodon csak egy aminosavat kódol, de egy aminosavat több különböző kodon is kódolhat. A genetikai kód szerint az UUU kodon kódolja a fenilalanin aminosavat és a UUA kód a leucint. De a Wobble-hipotézis szerint a kodon harmadik helyzetének és az antikodonnak az alapjának nem kell egymást kiegészítenie (ami segít megmagyarázni, miért van nagyon kevés tRNS-molekula típus, annak ellenére, hogy 61 kodon létezik). Ha ez a hipotézis igaz, akkor a fenilalanint olyan helyzetbe hozhatjuk, amelyet leucinnak szántak, és fordítva (mivel az őket kódoló kodonok csak a harmadik bázisukban különböznek egymástól). Ugyanez vonatkozik olyan párokra, mint az aszparaginsav & glutaminsav és a szerin & arginin. Tehát hogyan eredményez egy adott mRNS molekula transzlációja a megfelelő polipeptid szekvenciát?

Kapcsolódó kérdés: [Miért 22 aminosav 64 helyett?] (Http://biology.stackexchange.com/questions/653/why-22-amino-acids-instead-of-64/)
Kettő válaszokat:
WYSIWYG
2014-10-27 17:05:38 UTC
view on stackexchange narkive permalink

A Wobble párosítás csak jelenség, és nem nehéz és gyors szabály. Van néhány igazolás arra, hogy miért kellene léteznie, és ezért hívják ma is hipotézisnek. És ez az állítás nem igaz: " a kodon harmadik helyzetének és az antikodonnak az alapja nem feltétlenül kiegészítő" . A kodon harmadik maradékának megfelelő antikodon-csoport lehet gátló bázis, amely két vagy sok különböző bázissal párosulhat. A fenilalanin tRNS-nek van egy antikodonja - GAA , amely párosulhat mind a UUU , mind a UUC -val, de nem a UUA -val.

A wobble-hipotézis állítása tehát az, hogy az antikodon első bázisa (gyakran módosított / atipikus nukleobázis) megmutathatja a kötődés ígéretét.

David
2016-06-01 01:10:26 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Helyesen állítja, hogy Crick Wobble-hipotézisében azt javasolta, hogy „a kodon harmadik helyzetének és az antikodonnak az alapja ne legyen kiegészítő jellegű”, de a Az állításod „nem kell” je a Crick eredeti nyilatkozatában szereplő „néhány” parafrázisa:

 „Javasoljuk, hogy míg a standard alappárokat meglehetősen szigorúan lehet használni a hármas első két pozíciójában, némi ingadozás lehet a harmadik alap párosításában. ”

Ha elolvassa ezt a papírt - vagy megtekinti a Wikipedia bejegyzését a Wobble alatt, akkor megtudja, hogy Crick a „néhány” szót használja arra, hogy jelezze:

(i ) A javasolt ingadozás bizonyos bázispárokra specifikus.

(ii) Ilyen ingatag bázispárok csak olyan esetekben találhatók meg, amikor nem sértik a genetikai kódot.

A Wobble hipotézis - mint fentebb említettük - egyértelműen helyesnek bizonyult . A konkrét Wobble szabályok amelyek Crick által az (i) pont kielégítésére javasoltak, az alapok kémiájának vizsgálatán alapultak, és részben helyesnek bizonyultak:

Wobble Bases: Prediction and Reality Wobble-szabályok: Crick eredet-előrejelzései a megfigyelt 5'-antikodon bázisokhoz és azok bázis-kodonokkal való párosításához képest.

Így azt a jóslatot igazolták, hogy az 5'-tRNS antikodon bázisok, G és I megingathatnák (és C nem). Crick tudatában volt az A hiányának ebben a helyzetben az antikodonokban, és mind az, mind az U általában kémiailag módosított formákban találhatók meg, amelyek alap-párosítását nem próbálta megjósolni (a legtöbbjükről nem volt tudomása), és amelyek különböző esetekben eltérő. Emlékeztetni kell arra, hogy ennek tudományos oka van a tRNS-ben lévő antikodon háromdimenziós felépítése (amely az első két bázist báziskészítéssel tartja helyzetben) és a potenciálisan hidrogénkötő csoportok közelsége szempontjából a különféle bázisokban.

A ii. pont szerint a Természet csak ott használja a Wobble-t, ahol a genetikai kód megengedi. A G C vagy U párosítása mindig működik, míg az A, C vagy G párosítás az aminosavakkal működik, amelyeket egy blokk mind a négy bázisa kódol (pl. Leu, Val, Ser), de nem ott, ahol kettőből álló blokkok vannak (pl. Tyr, His, Asn).

Egy utolsó pont, amely mindezek kémiai alapját hangsúlyozza. Az emlős mitokondriumokban a különlegesen megcsonkított tRNS-ek miatt más ingadozási szabályok vannak.

Nagyra értékelem, hogy ez egy régi kérdés, amelyre már megválaszolták (egy „kapcsolódó” felsorolásra hívták fel a figyelmemet. Mivel azonban volt néhány anyagom a témáról, úgy gondoltam, hogy hasznos lenne az előző választ kissé pontosítani.


Ezt a kérdést és választ automatikusan lefordították angol nyelvről.Az eredeti tartalom elérhető a stackexchange oldalon, amelyet köszönünk az cc by-sa 3.0 licencért, amely alatt terjesztik.
Loading...