Van-e olyan aminosav-szekvencia, amelyről tudjuk, hogy béta-lapra vagy alfa-spirálra kerül, vagy lényegében véletlenszerű?
Igen, vannak olyan aminosav-szekvenciák, amelyek hajlamosak alfa-hélixek kialakítására, és mások, amelyek inkább béta-lapokat alkotnak. A szekvencia és a szerkezet között nincs tökéletes megfelelés, de van olyan statisztikai összefüggés, ahol bizonyos aminosavak jelenléte bizonyos szekvenciákban egyik vagy másik konformációt valószínűbbé teszi. Például az alanin, glutamát, leucin és metionin általában jelen van az alfa-hélixekben. sorrend. Tekintse meg ezt az elérhető szoftverek listáját, és ezt a cikket a fehérjeszerkezet-előrejelzésről általában.
Tekintse meg ezt a táblázatot egy másik oldalról válasz ezen a webhelyen, amely megmutatja, melyik aminosav melyik másodlagos szerkezetet részesíti előnyben (a magasabb érték magasabb preferenciát mutat):